בבית האבות גן דוד, קיים בית כנסת מכובד המחולק לחדר תפילה  וחדר עזרת נשים. בית הכנסת משמש את דיירי הבית וכן מתפללים הגרים בשכנות ואלה, משמשים בחום ואהבה עזר לדיירים המגיעים ונעזרים בהליכונים וכסאות גלגלים. את בית הכנסת מנהל הרב אשר שוורץ, ומתקיימות בו 3 תפילות במהלך היום, בשבתות, ראש חודש וחגים, באווירה צעירה ומניין מלא:  תפילת שחרית (בכל יום בשעה 06:30, בשבתות ומועדים בשעה 08:00 בחול המועד וימים נוראים 07:00 ), תפילת מנחה ותפילת ערבית. בימי החול זמני מנחה וערבית משתנים בהתאם להשתנות היום ולנוחיות המתפללים.

הזמנים מתפרסמים על גבי מסך דיגיטלי הממוקם בבית הכנסת.

כמו כן, בכל ימות החול, בין תפילת מנחה לערבית ובשבתות לפני קריאת התורה, מתקיימים שיעורי תורה ע"י הרב אשר שוורץ, בנושאים שונים ובשבת בנושא פרשת השבוע.

בערבי שבת ובשבת מתקיימים שיעורי תורה גם ע"י אחד המתפללים. 

בגן דוד קימת חשיבות לערכים הדתיים כמו הדלקת נרות חנוכה ,קריאת המגילה, קידוש לכל דיירי המוסד בכל שבת ע"י הרב וכדומה.